宝应县水务局是宝应县政府管理水务工作的职能部门，依法对全县的防洪排涝、供水、排水、用水、节水、污水处理和回用、水资源保护等实施一体化管理。下辖14个基层水务站、4个灌区管理所和京杭运河管理处、水利技术推广中心、城市河道管理处，内设办公室、规基科、财审科、水政水资源科（水资源管理办公室、水政监察大队）、工管科、农水科、城水科和资产经营管理站等部门。

    多年来，宝应县水务局始终坚持把争创省、市文明行业和省水利系统文明标兵单位作为全局工中心作，切实加强组织领导，制定创建工作规划，精心组织，扎实开展各项创建活动，推动各项业务工作深入开展，取得显著工作成效，2009年被县政府通令嘉奖，2011年荣获县“上争国资创新突破金牌奖”， 2009-2010年度被江苏省水利厅评为全省水利系统文明标兵单位，先后获评扬州市文明行业和江苏省创建文明行业先进行业。