仪征市医疗保险管理处前身为仪征市城镇职工医疗保险管理处，成立于2001年6月，2012年6月更现名，为仪征市人力资源和社会保障局（前为仪征市劳动和社会保障局）下属全民事业单位。成立期初，主要行使城镇职工医疗保险经办职能；2004年7月，增加工伤、生育保险经办职能；2004年11月，增加离休干部医疗统筹服务管理职能；2007年10月，增加城镇居民医疗保险经办职能；2008年1月，增加新型农村合作医疗经办职能。